Los problemas que enfrentan los territorios son muchos y de muy diversa índole. Entre otros, son los siguientes, divididos de la siguiente manera:
a) Externos
1. Iniciativas de inversión poco responsables de cara al medioambiente.
2. Verticalismo a la hora de tomar las decisiones.
3. Centralismo.
4. Marco legislativo inapropiado.
5. Limites político administrativos que dividen a los territorios.
b) Internos
Conceptuales:
Modos de pensar desfasados para enfrentar la nueva realidad de los territorios (noción de desarrollo, relación bienes-mercado, relación global-local, democracia, frontera, importancia del saber tradicional, por ejemplo), relaciones inadecuadas entre los seres humanos, las sociedades y la biósfera.
Económicos:
Inexistencia de instrumentos de medición de la riqueza, capacidades humanas deficitarias.
Sociales:
Pobreza, inequidad social, conflictividad.
Políticos:
Democracia representativa no incorpora a la ciudadanía; ausencia de interés público en materia de participación;
Culturales:
Consumismo desenfrenado, esclavitud tecnológica, mal uso del tiempo, sobre todo en el medio urbano, discriminación, indiferencia ante la riqueza de la diversidad cultural.
Institucionales:
Ausencia de planificación, poca articulación inter territorial.
Ambientales:
Depredación de los ecosistemas; vulnerabilidad frente al cambio climático.